Empowering HIV-1 genotyping drug resistance monitoring: Sample to report

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Comprehensive, sensitive and accurate HIV-1 genotyping and DRM detection

HIV drug resistance poses a significant global challenge to the sustainability of antiretroviral therapy and is the most common cause of antiviral treatment failure in HIV patients. Next Generation Sequencing holds significant promise in providing scalable throughput, increased sensitivity and accuracy for detecting drug resistance mutations.
 
MGI has developed an HIV-1 drug resistance sample to report workflow to accurately characterize HIV drug resistance in both plasma and culture specimens. Based on deep sequencing, capable of detecting drug resistance with low-frequency mutation, and combined with MGI’s automated Sample Prep systems and HIV-GenomePro software, provides users with a streamlined tool for enabling rapid and accurate detection of HIV-1, drug resistance analysis, genome assembly, mutation detection, and evolutionary tracing.
 
MGI’s HIV -1 genotyping and drug resistance detection package can be deployed as a comprehensive and scalable solution, with the potential to improve individual patient care, as well as contributing to the ongoing research and genomic surveillance critical for the development of effective public health strategies in the fight against HIVDR and Antimicrobial Resistance.

HIV-1 Drug Resistance Sequencing workflow

DNA Extraktion & Bibliotheksvorbereitung

~7.5h
  • MGISP-960/MGISP-100

  • ATOPlex HIV-1 Amplifications Kit

  • MGIEasy Fast PCR-FREE FS DNA Library Prep Set

MGISP-960/MGISP-100  ATOPlex HIV-1 Amplifications Kit  MGIEasy Fast PCR-FREE FS DNA Library Prep Set
MGISP-100

DNA Extraktion & Bibliotheksvorbereitung

~12-40h
  • High-throughput Sequencing Set

  • DNBSEQ-G99 SM FCL PE150

  • DNBSEQ-E25 FCL PE150

Ein Bild des DNBSEQ-G99 Sequenziergeräts von MGI-Tech

DNA Extraktion & Bibliotheksvorbereitung

~1-2h
  • HIV-GenomePro Software

  • HIV-GenomePro Platform

HIV-GenomePro Software  HIV-GenomePro Platform

Precisely analyze and annotate drug resistance and explore with HIV-GenomePro Software

HIV-GenomePro Software
HIV-GenomePro Software
HIV-GenomePro Software

Funktionen

Genotype/subtype annotation
Data quality control
Coverage statistics
PR-RT-IN gene assembly
Virus evolution tracing analysis
SNP and InDel detection
PR-RT-IN gene drug resistance annotation based on Stanford University HIVDB database
Localization of HIV-TRACE for molecular network analysis
Datenqualitätskontrolle
Bestimmen Sie, ob die Virenkonzentration den Schwellenwert erreicht
Genomanalyse
Genom-Montage
Mehrfache Sequenz
Ausrichtung des HIV
Referenzgenoms
Phylogenetische
Baumberechnung
Ausgabe:
1. Konsistente Sequenz
2. Tippergebnisse
Referenz
Genom-Alignment
SNP-Aufruf
Mutationsdroge
Widerstand
Anmerkung
Ausgabe:
1. SNP-Lokus
2. Ergebnisse der evolutionären Analyse
Ergebnisse zusammenfassen und Bericht erstellen

Next-Generation-Metagenomik mit DNBSEQ-G99

Beispiel für genetischen Code: Sequenzierung mit Lichtgeschwindigkeit!

Bibliotheksvorbereitung

Sequenzierung

Datenanalyse

Stuhl-DNA (Meta) Extraktionskit, Verbesserte Metagenomik:
Optimierte Stuhldna-Extraktion mit MGISP-NE384/MGISP-960 für umfassende metagenomische Analysen.

Stuhl-DNA (Meta) Extraktionskit, Verbesserte Metagenomik:
Optimierte Stuhldna-Extraktion mit MGISP-NE384/MGISP-960 für umfassende metagenomische Analysen.

Stuhl-DNA (Meta) Extraktionskit, Verbesserte Metagenomik:

Optimierte Stuhldna-Extraktion mit MGISP-NE384/MGISP-960 für umfassende metagenomische Analysen.

Stuhl-DNA (Meta) Extraktionskit, Verbesserte Metagenomik:
Optimierte Stuhldna-Extraktion mit MGISP-NE384/MGISP-960 für umfassende metagenomische Analysen.

MGISP-100 Automationsmaschine von MGI-Tech

Next-Generation-Metagenomik mit DNBSEQ-G99

Beispiel für genetischen Code: Sequenzierung mit Lichtgeschwindigkeit!

Bibliotheksvorbereitung

Sequenzierung

Datenanalyse

Stuhl-DNA (Meta) Extraktionskit, Verbesserte Metagenomik:
Optimierte Stuhldna-Extraktion mit MGISP-NE384/MGISP-960 für umfassende metagenomische Analysen.

Stuhl-DNA (Meta) Extraktionskit, Verbesserte Metagenomik:
Optimierte Stuhldna-Extraktion mit MGISP-NE384/MGISP-960 für umfassende metagenomische Analysen.

Stuhl-DNA (Meta) Extraktionskit, Verbesserte Metagenomik:

Optimierte Stuhldna-Extraktion mit MGISP-NE384/MGISP-960 für umfassende metagenomische Analysen.

Stuhl-DNA (Meta) Extraktionskit, Verbesserte Metagenomik:
Optimierte Stuhldna-Extraktion mit MGISP-NE384/MGISP-960 für umfassende metagenomische Analysen.

MGISP-100 Automationsmaschine von MGI-Tech

Next-Generation-Metagenomik mit DNBSEQ-G99

Beispiel für genetischen Code: Sequenzierung mit Lichtgeschwindigkeit!

Bibliotheksvorbereitung

Sequenzierung

Datenanalyse

Stuhl-DNA (Meta) Extraktionskit, Verbesserte Metagenomik:
Optimierte Stuhldna-Extraktion mit MGISP-NE384/MGISP-960 für umfassende metagenomische Analysen.

Stuhl-DNA (Meta) Extraktionskit, Verbesserte Metagenomik:
Optimierte Stuhldna-Extraktion mit MGISP-NE384/MGISP-960 für umfassende metagenomische Analysen.

Stuhl-DNA (Meta) Extraktionskit, Verbesserte Metagenomik:

Optimierte Stuhldna-Extraktion mit MGISP-NE384/MGISP-960 für umfassende metagenomische Analysen.

Stuhl-DNA (Meta) Extraktionskit, Verbesserte Metagenomik:
Optimierte Stuhldna-Extraktion mit MGISP-NE384/MGISP-960 für umfassende metagenomische Analysen.

MGISP-100 Automationsmaschine von MGI-Tech

Kombinieren Sie Präzision und Leistung mit dem DNBSEQ-G99

DNBSEQ-G99

DNBSEQ-E25

Beispiel pro Lauf Icon
Proben pro Lauf

≤16 samples /FC

MGI-Flowzellen-Symbol
Flusszellen

1

Längen lesen

FCL PE150

Zeit

31h

DNBSEQ-G99

DNBSEQ-E25

Beispiel pro Lauf Icon
Proben pro Lauf

≤60 samples /FC

MGI-Flowzellen-Symbol
Flusszellen

2

Längen lesen

FCL PE150

Zeit

24h

Zertifizierung

ISO 13485

Qualitätsmanagementsystem für Medizinprodukte

ISO 14001

Umweltmanagementsystem

ISO 27001

Informations-Sicherheitsmanagementsystem

Zertifizierung

ISO 13485

Qualitätsmanagementsystem für Medizinprodukte

ISO 14001

Umweltmanagementsystem

ISO 27001

Informations-Sicherheitsmanagementsystem

Zertifizierung

ISO 13485

Qualitätsmanagementsystem für Medizinprodukte

ISO 14001

Umweltmanagementsystem

ISO 27001

Informations-Sicherheitsmanagementsystem

Zertifizierung

ISO 13485

Qualitätsmanagementsystem für Medizinprodukte

ISO 14001

Umweltmanagementsystem

ISO 27001

Informations-Sicherheitsmanagementsystem

Ressourcen

Brochure & Manuals

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Urheberrecht © 2024 MGI tech GmbH, Ltd. Alle Rechte vorbehalten.

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