cfDNA und Sequenzierung, ein "eins-zwei Punch", um Krebs in Runde 1 auszuschalten

20.07.2023

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Dr. Weilin Liu

Dr. Weilin Liu - Field Application Scientist bei MGI

Erkunden Sie die Rolle von zellfreier DNA (cfDNA) bei der frühzeitigen Krebserkennung und wie die integrative Modellierung von Tumorgenomen und Epigenomen die Prognose verbessert. Erfahren Sie mehr über die hervorragende Leistungsfähigkeit von MGI-Daten und die Zukunft der auf cfDNA basierenden Krebsdiagnose.
Erkunden Sie die Rolle von zellfreier DNA (cfDNA) bei der frühzeitigen Krebserkennung und wie die integrative Modellierung von Tumorgenomen und Epigenomen die Prognose verbessert. Erfahren Sie mehr über die hervorragende Leistungsfähigkeit von MGI-Daten und die Zukunft der auf cfDNA basierenden Krebsdiagnose.
Erkunden Sie die Rolle von zellfreier DNA (cfDNA) bei der frühzeitigen Krebserkennung und wie die integrative Modellierung von Tumorgenomen und Epigenomen die Prognose verbessert. Erfahren Sie mehr über die hervorragende Leistungsfähigkeit von MGI-Daten und die Zukunft der auf cfDNA basierenden Krebsdiagnose.

Die Rolle von cfDNA bei der Früherkennung von Krebs

Es wurde durch ausreichende klinische Studien gezeigt, dass Krebs eine bessere Prognose und Überlebensrate aufweist, wenn er früher diagnostiziert und behandelt wird. Daher spielt die frühzeitige Erkennung von Krebs und seinen Markern eine entscheidende Rolle bei der Krebsintervention und -behandlung. Zellfreie DNA (cfDNA) bietet aufgrund des Vorhandenseins von zirkulierender TumordNA (ctDNA), die tumorspezifische genetische und epigenetische Veränderungen widerspiegelt und körperlich kürzer als normale cfDNAs ist, einen nicht-invasiven und leicht zugänglichen Weg für die frühzeitige Erkennung und Überwachung von Multi-Krebs. Die frühzeitige Erkennung durch die flüssige Biopsiemethode auf der Basis von cfDNA bleibt jedoch eine Herausforderung aufgrund ihrer noch zu verbessernden Sensitivität im Vergleich zur späten Entdeckung.

 

Verbesserung der Krebsprognose durch integrative Modellierung

Um dieses Problem anzugehen und die Krebsprognose weiter zu verbessern, wurde kürzlich in Nature Communication eine wegweisende Arbeit zur integrativen Modellierung Bae et al., Nat Commun, 2023 von Tumorgenomen und Epigenomen cfDNA veröffentlicht, die zeigt, dass ihr Algorithmus Frühstadien von Krebs mit hoher Sensitivität erkennt, die vergleichbar mit der von Spätstadien ist. Darüber hinaus zeigt die Modellinterpretation den Beitrag von krebstypspezifischen genomischen und epigenomischen Merkmalen auf. Insgesamt wurden 3366 Proben in 2 Kohorten auf MGI DNBSEQ G400 und Illumina Novaseq-6000 mit PE100 sequenziert.

Hervorragende Leistung von MGI-Daten und zukünftige Richtungen

Bei einer Spezifität von 95% hatte das kombinierte Modell eine höhere Empfindlichkeit von 91,1% bei den MGI-Daten für Stufe-I-Krebs im Vergleich zu 79,6% der Illumina-Daten. Darüber hinaus wurde eine Evaluierung für jeden Tumortyp durchgeführt, um die Genauigkeit bei der Lokalisierung des Ursprungsgewebes zu zeigen. Die Genom- und Epigenommodelle sowohl der MGI- als auch der Illumina-Kohorten schnitten besser ab als die bestehenden Methoden, und weitere Verbesserungen wurden erzielt, als die beiden Modelle kombiniert wurden. Insgesamt zeigt eine bessere Leistung bei den MGI-Daten im Vergleich zu den Illumina-Daten, dass die überlegene Datenqualität und höhere Lesetiefen, die durch die MGI DNBSEQ-Plattform zusammen mit ihrem cfDNA-Bibliotheksset erreicht wurden, zur Vorhersagegenauigkeit beitragen. Die in dieser Studie vorgeschlagenen Methoden legen den Grundstein für eine genaue cfDNA-basierte Krebsdiagnose, insbesondere in frühen Stadien. Die Ergebnisse könnten weiter verbessert werden, wenn sie mit integrativem Modellieren basierend auf Tumorbiologie, einer zunehmenden Anzahl von Referenz- und cfDNA-Analyse-Trainingsdaten gekoppelt werden, um eine ultrasensitive Früherkennung von Krebs und eine genaue Krebsdiagnose zu ermöglichen.

Über MGI

MGI Tech Co., Ltd. (MGI) steht an vorderster Front globaler Innovationen und trägt aktiv zur Lebenswissenschaft durch intelligente Innovation bei. Mit Präsenz in über 100 Ländern und einer Kundenbasis von 2600+ hat MGIs modernste Technologie wesentlich zur Entwicklung von über 736 Benutzerpatenten beigetragen und die Erstellung von über 150 Petabyte an Daten ermöglicht. Das umfangreiche Portfolio des Unternehmens umfasst Sequenzierinstrumente, Automationsinstrumente, Reagenzien und verwandte Produkte, die verschiedene Bereiche wie die Lebenswissenschaftsforschung, Landwirtschaft, Präzisionsmedizin und Gesundheitswesen abdecken.

MGI widmet sich der Weiterentwicklung von Lebenswissenschaftswerkzeugen für die Gesundheitsversorgung der Zukunft. Bis Dezember 2021 hat MGIs globale Präsenz auf mehr als 100 Länder und Regionen erweitert und bedient über 1300 internationale Kunden. Mit einer Belegschaft von über 2900 Fachleuten weltweit, darunter 5 Forschungs- und Entwicklungszentren sowie Produktionsstätten in Europa, verpflichtet sich MGI zur Förderung von Innovationen. Ungefähr 35% der Mitarbeiter von MGI sind an Forschung und Entwicklung beteiligt, was das Engagement des Unternehmens für wegweisende Fortschritte in der Branche unterstreicht.

Die Auswirkungen von MGIs Arbeit werden durch die Veröffentlichung von über 6800 Artikeln in renommierten wissenschaftlichen Zeitschriften deutlich, was den erheblichen Beitrag von MGIs Technologie für die wissenschaftliche Gemeinschaft und darüber hinaus zeigt.

Weitere Informationen über MGI und seine Beiträge zu Lebenswissenschaften und Gesundheitswesen finden Sie auf der MGI-Website oder treten Sie mit uns in Verbindung auf Twitter, LinkedIn oder YouTube.

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Urheberrecht © 2024 MGI tech GmbH, Ltd. Alle Rechte vorbehalten.

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