La prochaine génération de séquençage peut-elle accélérer le développement de vaccins à ARNm ?

10 oct. 2023

Dr. Weilin Liu

Dr. Weilin Liu - Scientifique en application sur le terrain chez MGI

La prochaine génération de séquençage peut-elle accélérer le développement de vaccins à ARNm ?
La prochaine génération de séquençage peut-elle accélérer le développement de vaccins à ARNm ?
La prochaine génération de séquençage peut-elle accélérer le développement de vaccins à ARNm ?

Katalin Karikó et Drew Weissman se sont vus décerner le prix Nobel 2023 de Physiologie ou Médecine pour leurs découvertes subtiles mais significatives concernant les modifications de la base nucléosidique (Fig1.), à savoir le remplacement de l'uridine par la N1-méthylpseudouridine (m1Ψ), qui sert de pierre angulaire pour rendre la livraison d'ARNm non immunogène et permettre le développement de vaccins à ARNm contre le COVID-19 avec une efficacité et une rapidité sans précédent, sauvant des millions de vies et mettant fin non seulement à la pandémie d'une maladie mais aussi au fardeau catastrophique de la santé à l'échelle mondiale.

Actuellement, de nombreuses nouvelles thérapies basées sur l'ARNm ont été vigoureusement développées pour une grande variété de maladies, y compris d'autres agents pathogènes infectieux, le cancer et les maladies auto-immunes. Pendant ce temps, les préoccupations concernant sa sécurité et ses effets secondaires potentiels ont incontestablement surgi comme cela s'est produit avec d'autres nouveaux traitements. Bien que diverses techniques, telles que la RT-qPCR, l'électrophorèse capillaire en gel, l'IP-RP-HPLC et l'immunobuvage, aient été mises en œuvre dans l'analyse de qualité des vaccins à ARNm, ces méthodes sont fastidieuses, coûteuses et manquent de sensibilité dans la détection des caractéristiques essentielles de l'ARNm. Par conséquent, une demande d'une méthode analytique robuste et combinatoire est nécessaire de toute urgence pour évaluer l'intégrité, l'efficacité des vaccins à ARNm, et surtout pour surveiller les contaminants et les effets hors cible afin de répondre à ces préoccupations en matière de sécurité et de spécificité. Au cours des dernières années, la technologie de séquençage de nouvelle génération a progressé à un rythme rapide sur plusieurs aspects, notamment l'augmentation de la capacité de débit de séquençage, la vitesse, la précision, la réduction significative des coûts et le développement de longues lectures, favorisant ses diverses applications à la fois dans la recherche et le diagnostic clinique. Le séquençage de nouvelle génération peut-il aider au développement et à la validation des vaccins et thérapies à ARNm ?


Une étude de séquençage de l'ARN publiée récemment dans Nature communication a combiné et évalué à la fois le séquençage à lectures courtes et longues pour l'analyse des vaccins et des thérapies à ARNm. L'étude a proposé une méthode rationalisée, le flux de travail VAX-seq (Gunter et al., 2023) suivi d'un outil bioinformatique intégré appelé Mana pour obtenir une évaluation complète de ces attributs clés de l'ARNm, notamment l'intégrité de la séquence, la longueur de la queue poly(A) en 3'-extrémité et les contaminants d'ADN/ARN (Fig. 2). De plus, VAX-seq fournit également une solution pour détecter les ARN hors cible, qui sont générés au cours de la transcription in vitro sous forme d'ARN tronqués, lisibles ou antisens déclenchant une réponse immunitaire innée. Le séquençage à longues et courtes lectures a révélé un pourcentage similaire d'ARN cible et hors cible.

À propos de MGI

MGI Tech Co., Ltd. (MGI) est à l'avant-garde de l'innovation mondiale, contribuant activement aux sciences de la vie grâce à l'innovation intelligente. Présente dans plus de 100 pays et comptant plus de 2600 clients, la technologie de pointe de MGI a été essentielle dans le développement de plus de 736 brevets d'utilisateur, facilitant la création de plus de 150 pétaoctets de données. Le vaste portefeuille de l'entreprise comprend des instruments de séquençage, des instruments d'automatisation, des réactifs et des produits connexes qui répondent à divers secteurs tels que la recherche en sciences de la vie, l'agriculture, la médecine de précision et les soins de santé.

MGI s'engage à faire progresser les outils des sciences de la vie pour la santé de l'avenir. En décembre 2021, la présence mondiale de l'entreprise s'est étendue à plus de 100 pays et régions, desservant plus de 1 300 clients internationaux. Avec une équipe de plus de 2 900 professionnels dans le monde entier, y compris 5 centres de recherche et développement et des installations de production en Europe, MGI s'engage à favoriser l'innovation. Environ 35% des employés de MGI sont impliqués dans la R&D, soulignant l'accent mis par l'entreprise sur les avancées pionnières dans le domaine.

L'impact du travail de MGI est également attesté par la publication de plus de 6 800 articles dans des revues scientifiques prestigieuses, mettant en évidence la contribution significative de la technologie de MGI à la communauté scientifique et au-delà.

Pour plus d'informations sur MGI et ses contributions aux sciences de la vie et aux soins de santé, veuillez visiter le site Web de MGI ou nous suivre sur Twitter, LinkedIn ou YouTube.

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