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Empowering HIV-1 genotyping drug resistance monitoring: Sample to report

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Comprehensive, sensitive and accurate HIV-1 genotyping and DRM detection

HIV drug resistance poses a significant global challenge to the sustainability of antiretroviral therapy and is the most common cause of antiviral treatment failure in HIV patients. Next Generation Sequencing holds significant promise in providing scalable throughput, increased sensitivity and accuracy for detecting drug resistance mutations.
 
MGI has developed an HIV-1 drug resistance sample to report workflow to accurately characterize HIV drug resistance in both plasma and culture specimens. Based on deep sequencing, capable of detecting drug resistance with low-frequency mutation, and combined with MGI’s automated Sample Prep systems and HIV-GenomePro software, provides users with a streamlined tool for enabling rapid and accurate detection of HIV-1, drug resistance analysis, genome assembly, mutation detection, and evolutionary tracing.
 
MGI’s HIV -1 genotyping and drug resistance detection package can be deployed as a comprehensive and scalable solution, with the potential to improve individual patient care, as well as contributing to the ongoing research and genomic surveillance critical for the development of effective public health strategies in the fight against HIVDR and Antimicrobial Resistance.

HIV-1 Drug Resistance Sequencing workflow

Extraction d'ADN et préparation de la bibliothèque

~7.5h
  • MGISP-960/MGISP-100

  • ATOPlex HIV-1 Amplifications Kit

  • MGIEasy Fast PCR-FREE FS DNA Library Prep Set

MGISP-960/MGISP-100  ATOPlex HIV-1 Amplifications Kit  MGIEasy Fast PCR-FREE FS DNA Library Prep Set
MGISP-100

Extraction d'ADN et préparation de la bibliothèque

~12-40h
  • High-throughput Sequencing Set

  • DNBSEQ-G99 SM FCL PE150

  • DNBSEQ-E25 FCL PE150

Une photo du séquenceur DNBSEQ-G99 de MGI-Tech

Extraction d'ADN et préparation de la bibliothèque

~1-2h
  • HIV-GenomePro Software

  • HIV-GenomePro Platform

HIV-GenomePro Software  HIV-GenomePro Platform

Precisely analyze and annotate drug resistance and explore with HIV-GenomePro Software

HIV-GenomePro Software
HIV-GenomePro Software
HIV-GenomePro Software

Features

Genotype/subtype annotation
Data quality control
Coverage statistics
PR-RT-IN gene assembly
Virus evolution tracing analysis
SNP and InDel detection
PR-RT-IN gene drug resistance annotation based on Stanford University HIVDB database
Localization of HIV-TRACE for molecular network analysis
Data quality control
Determine if virus concentration reaches threshold
Genomic analysis
Genome assembly
Multiple sequence
alignment of HIV
reference genome
Phylogenetic
tree calculation
Output:
1. Consistent sequence
2. Typing results
Reference
genome alignment
SNP Calling
Mutation drug
Resistance
annotation
Output:
1. SNP locus
2.Evolutionary analysis results
Summarize results and generate report

Métagénomique de prochaine génération avec DNBSEQ-G99

De l'échantillon au code génétique : séquençage à la vitesse de la lumière !

Préparation de la bibliothèque

Séquençage

Analyse des données

Kit d'extraction d'ADN fécal (Méta), métagénomique améliorée:
Extraction simplifiée de l'ADN fécal avec MGISP-NE384/MGISP-960 pour une analyse métagénomique complète.

Kit d'extraction d'ADN fécal (Méta), métagénomique améliorée:
Extraction simplifiée de l'ADN fécal avec MGISP-NE384/MGISP-960 pour une analyse métagénomique complète.

Kit d'extraction d'ADN fécal (Méta), métagénomique améliorée:

Extraction simplifiée de l'ADN fécal avec MGISP-NE384/MGISP-960 pour une analyse métagénomique complète.

Kit d'extraction d'ADN fécal (Méta), métagénomique améliorée:
Extraction simplifiée de l'ADN fécal avec MGISP-NE384/MGISP-960 pour une analyse métagénomique complète.

Machine d'automatisation MGISP-100 de MGI-Tech

Métagénomique de prochaine génération avec DNBSEQ-G99

De l'échantillon au code génétique : séquençage à la vitesse de la lumière !

Préparation de la bibliothèque

Séquençage

Analyse des données

Kit d'extraction d'ADN fécal (Méta), métagénomique améliorée:
Extraction simplifiée de l'ADN fécal avec MGISP-NE384/MGISP-960 pour une analyse métagénomique complète.

Kit d'extraction d'ADN fécal (Méta), métagénomique améliorée:
Extraction simplifiée de l'ADN fécal avec MGISP-NE384/MGISP-960 pour une analyse métagénomique complète.

Kit d'extraction d'ADN fécal (Méta), métagénomique améliorée:

Extraction simplifiée de l'ADN fécal avec MGISP-NE384/MGISP-960 pour une analyse métagénomique complète.

Kit d'extraction d'ADN fécal (Méta), métagénomique améliorée:
Extraction simplifiée de l'ADN fécal avec MGISP-NE384/MGISP-960 pour une analyse métagénomique complète.

Machine d'automatisation MGISP-100 de MGI-Tech

Métagénomique de prochaine génération avec DNBSEQ-G99

De l'échantillon au code génétique : séquençage à la vitesse de la lumière !

Préparation de la bibliothèque

Séquençage

Analyse des données

Kit d'extraction d'ADN fécal (Méta), métagénomique améliorée:
Extraction simplifiée de l'ADN fécal avec MGISP-NE384/MGISP-960 pour une analyse métagénomique complète.

Kit d'extraction d'ADN fécal (Méta), métagénomique améliorée:
Extraction simplifiée de l'ADN fécal avec MGISP-NE384/MGISP-960 pour une analyse métagénomique complète.

Kit d'extraction d'ADN fécal (Méta), métagénomique améliorée:

Extraction simplifiée de l'ADN fécal avec MGISP-NE384/MGISP-960 pour une analyse métagénomique complète.

Kit d'extraction d'ADN fécal (Méta), métagénomique améliorée:
Extraction simplifiée de l'ADN fécal avec MGISP-NE384/MGISP-960 pour une analyse métagénomique complète.

Machine d'automatisation MGISP-100 de MGI-Tech

Combinez précision et performance avec le DNBSEQ-G99

DNBSEQ-G99

DNBSEQ-E25

Icône d'échantillons par exécution
Échantillons par exécution

≤16 samples /FC

Icône des cellules MGI Flow
Cellules de flux

1

Longueurs de lecture

FCL PE150

Temps

31h

DNBSEQ-G99

DNBSEQ-E25

Icône d'échantillons par exécution
Échantillons par exécution

≤60 samples /FC

Icône des cellules MGI Flow
Cellules de flux

2

Longueurs de lecture

FCL PE150

Temps

24h

Certification

ISO 13485

Système de gestion de la qualité des dispositifs médicaux

ISO 14001

Système de gestion environnementale

ISO 27001

Système de gestion de la sécurité de l'information

Certification

ISO 13485

Système de gestion de la qualité des dispositifs médicaux

ISO 14001

Système de gestion environnementale

ISO 27001

Système de gestion de la sécurité de l'information

Certification

ISO 13485

Système de gestion de la qualité des dispositifs médicaux

ISO 14001

Système de gestion environnementale

ISO 27001

Système de gestion de la sécurité de l'information

Certification

ISO 13485

Système de gestion de la qualité des dispositifs médicaux

ISO 14001

Système de gestion environnementale

ISO 27001

Système de gestion de la sécurité de l'information

Ressources

Brochure & Manuals

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