cfDNA и секвенирование, «удар одновременно двумя кулаками», чтобы вырубить рак на 1 раунде

20 июл. 2023 г.

Share article
Доктор Уэйлин Лиу

Д-р Вэйлин Лю — научный сотрудник по прикладным исследованиям в MGI

Изучите роль свободной ДНК (cfDNA) в раннем выявлении рака и то, как интегративное моделирование геномов и эпигеномов опухолей улучшает прогноз. Узнайте о превосходной производительности данных MGI и будущем диагностирования рака на основе cfDNA.
Изучите роль свободной ДНК (cfDNA) в раннем выявлении рака и то, как интегративное моделирование геномов и эпигеномов опухолей улучшает прогноз. Узнайте о превосходной производительности данных MGI и будущем диагностирования рака на основе cfDNA.
Изучите роль свободной ДНК (cfDNA) в раннем выявлении рака и то, как интегративное моделирование геномов и эпигеномов опухолей улучшает прогноз. Узнайте о превосходной производительности данных MGI и будущем диагностирования рака на основе cfDNA.

Роль cfDNA в раннем выявлении рака

Было показано, что рак имеет лучший прогноз и выживаемость при более раннем диагнозе и лечении, поэтому раннее выявление рака и их маркеров играет решающую роль в вмешательстве и лечении рака. Свободная ДНК (cfDNA) предоставляет неинвазивный и легко доступный способ мультиканального раннего выявления и мониторинга рака благодаря наличию циркулирующей опухолевой ДНК (ctDNA), которая отражает опухоле-специфические генетические и эпигенетические изменения, и физически короче, чем нормальная cfDNA. Однако такое раннее выявление методом жидкостной биопсии на основе cfDNA по-прежнему остается проблемой из-за еще неулучшенной чувствительности по сравнению с выявлением на поздних стадиях.

 

Улучшение прогноза рака с помощью интегративного моделирования

Чтобы решить эту проблему и далее улучшить прогноз рака, важная работа по интегративному моделированию Bae et al., Nat Commun, 2023 геномов опухолей и эпигеномов cfDNA недавно была опубликована в Nature Communication, показав, что ее алгоритм обнаруживает рак ранней стадии с высокой чувствительностью, сравнимой с той, что обнаружена на поздней стадии. Более того, интерпретация модели показывает вклад типа рака-специфических геномических и эпигеномных особенностей. Всего 3366 образцов были разделены на 2 когорты, секвенированные на платформах MGI DNBSEQ G400 и Illumina Novaseq-6000 с использованием PE100, соответственно.

Превосходная производительность данных MGI и перспективы развития

При специфичности 95% комбинированная модель обладала выше чувствительностью 91,1% на данных MGI по сравнению с 79,6% на данных Illumina для определения рака I стадии. Более того, была проведена оценка по типам опухолей для выявления точности локализации тканей происхождения. Модели генома и эпигенома как от MGI, так и от испытуемых Illumina, превзошли существующие методы, и дальнейшие улучшения были достигнуты при объединении этих двух моделей. В целом, лучшие результаты достигнуты на данных MGI по сравнению с данными Illumina, что свидетельствует о высоком качестве данных и большей глубине считывания, достигнутых благодаря платформе MGI DNBSEQ вместе с ее набором библиотек cfDNA, оказывают влияние на точность прогноза. Предложенные в этом исследовании методики заложили основу для точной диагностики рака на основе cfDNA, особенно на ранних стадиях. Результаты могут быть дополнительно улучшены при совмещении с интегративным моделированием на основе опухолевой биологии, увеличивающимся количеством ссылочных данных и данных обучения cfDNA-анализу, чтобы достичь ультрачувствительного раннего выявления рака и точной диагностики.

О MGI

MGI Tech Co., Ltd. (MGI) находится на передовых позициях глобальных инноваций и активно вносит свой вклад в жизненные науки через интеллектуальные инновации. С наличием в более чем 100 странах и клиентской базой из 2600+, передовые технологии MGI сыграли важную роль в разработке 736+ патентов пользователей, способствуя созданию более 150 петабайт данных. Обширный портфель компании включает приборы для секвенирования, автоматизированные приборы, реагенты и связанные продукты, охватывающие различные секторы, такие как научные исследования в области жизни, сельское хозяйство, точная медицина и здравоохранение.

MGI посвятила себя продвижению инструментов для жизненных наук для здравоохранения будущего. К декабрю 2021 года глобальное присутствие компании расширилось на более чем 100 стран и регионов, обслуживая более 1300 международных клиентов. Сотрудники компании в общей сложности более 2900 человек по всему миру, включая 5 центров для исследований и разработок и производственные площадки в Европе, MGI нацелена на инновации. Приблизительно 35% сотрудников MGI заняты в области исследований и разработок, что подчеркивает фокус компании на пионерские достижения в этой области.

Важность работы MGI также подтверждается публикацией более 6800 статей в престижных научных журналах, демонстрируя значительный вклад технологий MGI в научное сообщество и не только.

Для получения дополнительной информации о MGI и ее вкладе в науку о жизни и здравоохранение посетите веб-сайт MGI или свяжитесь с нами в Twitter, LinkedIn или YouTube.

Разработка вакцины mRNA

Секвенирование следующего поколения

Рабочий процесс VAX-seq

Нобелевская премия по медицине

Поделиться этой статьей :

Поделиться

Больше Науки

Smart-seq3Xpress: масштабируемая, высокочувствительная и недорогая методология одиночной клеточной секвенирования полной длины РНК.
Smart-seq3Xpress: масштабируемая, высокочувствительная и недорогая методология одиночной клеточной секвенирования полной длины РНК.
Smart-seq3Xpress: масштабируемая, высокочувствительная и недорогая методология одиночной клеточной секвенирования полной длины РНК.
Smart-seq3Xpress: масштабируемая, высокочувствительная и недорогая методология одиночной клеточной секвенирования полной длины РНК.

5 мар. 2024 г.

Smart-seq3Xpress: масштабируемая, высокочувствительная и недорогая методология одиночной клеточной секвенирования полной длины РНК.

Революционизация одноклеточного РНК-секвенирования, SMART-seq3Xpress предлагает беспрецедентную чувствительность и экономичность с полным покрытием всей длины.

Одноклеточная пространственная транскриптомика (sc-StereoSeq) - открытие новой эры в биологии растений и сельском хозяйстве.
Одноклеточная пространственная транскриптомика (sc-StereoSeq) - открытие новой эры в биологии растений и сельском хозяйстве.
Одноклеточная пространственная транскриптомика (sc-StereoSeq) - открытие новой эры в биологии растений и сельском хозяйстве.
Одноклеточная пространственная транскриптомика (sc-StereoSeq) - открытие новой эры в биологии растений и сельском хозяйстве.

10 янв. 2024 г.

Одноклеточная пространственная транскриптомика (sc-StereoSeq) - открытие новой эры в биологии растений и сельском хозяйстве.

Изучите, как sc-StereoSeq преобразует наше понимание растительной биологии, от производства урожая до реакций растений на стресс, знаменуя новую эру в пространственной транскриптомике.

Может ли секвенирование следующего поколения ускорить разработку вакцин на основе мРНК?
Может ли секвенирование следующего поколения ускорить разработку вакцин на основе мРНК?
Может ли секвенирование следующего поколения ускорить разработку вакцин на основе мРНК?
Может ли секвенирование следующего поколения ускорить разработку вакцин на основе мРНК?

10 окт. 2023 г.

Может ли секвенирование следующего поколения ускорить разработку вакцин на основе мРНК?

Исследуйте трансформационное влияние секвенирования следующего поколения в разработке вакцин mRNA. Погрузитесь в открытия, удостоенные Нобелевской премии, вызовы и новые технологии, такие как рабочий процесс VAX-seq, улучшающие производство вакцин, безопасность и анализ качества в условиях мировых здравоохранительных кризисов.

Присоединяйтесь к нашему информационному бюллетеню, чтобы быть в курсе новых функций и выпусков.

Я прочитал и понял Политику конфиденциальности MGI, и даю согласие на сбор и обработку моих персональных данных для обработки, ответа на мой контакт, получения вашего информационного бюллетеня, а также на проведение промоакций и маркетинговых мероприятий.

Присоединяйтесь к нашему информационному бюллетеню, чтобы быть в курсе новых функций и выпусков.

Я прочитал и понял Политику конфиденциальности MGI, и даю согласие на сбор и обработку моих персональных данных для обработки, ответа на мой контакт, получения вашего информационного бюллетеня, а также на проведение промоакций и маркетинговых мероприятий.

Присоединяйтесь к нашему информационному бюллетеню, чтобы быть в курсе новых функций и выпусков.

Я прочитал и понял Политику конфиденциальности MGI, и даю согласие на сбор и обработку моих персональных данных для обработки, ответа на мой контакт, получения вашего информационного бюллетеня, а также на проведение промоакций и маркетинговых мероприятий.